Virtual Screening Berbasis Farmakofor Modelling Dan Molekular Docking Untuk Inhibitor HIV-1 Integrase

Human Immunodeficiency Virus (HIV) merupakan virus yang menyerang sel darah putih (limfosit) khususnya CD4, sehingga menyebabkan kekebalan tubuh pada manusia menjadi menurun dan tubuh mudah terkena berbagai gejala penyakit (AIDS). Enzim integrase merupakan salah satu enzim yang sangat penting bagi kemampuan virus untuk bertahan hidup. Penelitian ini dilakukan untuk menyeleksi kandidat senyawa obat baru yang berpotensi aktif menghambat enzim integrase sebagai obat HIV 1. Untuk mendapatkan senyawa obat baru, dilakukan metode virtual screening berbasis pharmacophore modeling menggunakan software LigandScout 4.5 dan molecular docking menggunakan software AutodockTools terhadap database ZINC Natural Product. Hasil tahapan Pharmacophore modeling didapatkan 9.276 senyawa dari 134.666 senyawa dengan nilai AUC100% sebesar 0.74 dan EF100% sebesar 1.3 dengan nilai pharmacophore fit score rata-rata 76.83. Untuk validasi molecular docking menggunakan AutodockTools didapatkan nilai energi ikatan ligan alami yaitu -7.688 kkal/mol dan nilai konstanta inhibisi 357.73 nm dengan nilai RMSD sebesar 1.688 Å. Didapatkan 1 kandidat hits yang diduga berpotensi sebagai inhibitor integrase HIV 1 yaitu ZINC84154372 yang memiliki nilai energi ikatan bebas Gibbs (∆G) sebesar -7.75 kcal/mol dan konstanta inhibisi (Ki) sebesar 2.75 uM dan memiliki ikatan hidrogen yang berikan dengan residu asam amino yaitu LYS188 dan HIS183.

Kata Kunci: HIV/AIDS, enzim integrase HIV 1, pharmacophore modeling, molecular docking, screening virtual