Studi Penambatan Molekul dan Simulasi Dinamika Molekul Senyawa Kimia dari Daun Pacing (Costus Speciosus) terhadap Reseptor Alfa Glukosidase sebagai Antidiabetes tipe 2

Diabetes melitus tipe II (DMT2) merupakan penyakit metabolik kronis yang ditandai oleh resistensi insulin dan gangguan metabolisme glukosa. Salah satu pendekatan terapeutik yang menjanjikan dalam pengelolaan DMT2 adalah penghambatan enzim alfa glukosidase, yang berperan dalam pemecahan karbohidrat kompleks menjadi glukosa. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi potensi senyawa aktif dari daun pacing (Costus speciosus) sebagai inhibitor alfa glukosidase melalui pendekatan in silico, menggunakan metode penambatan molekul dan simulasi dinamika molekul. Sebanyak 41 senyawa dari daun pacing diuji terhadap enzim alfa glukosidase (PDB ID: 2QMJ). Proses docking dilakukan menggunakan perangkat lunak AutoDock 4.2.6, dengan validasi metode berdasarkan nilai RMSD ≤ 2 Å. Senyawa dengan nilai afinitas terbaik kemudian dianalisis lebih lanjut menggunakan simulasi dinamika molekul selama 100 ns dengan perangkat lunak AMBER v18. Parameter yang dianalisis meliputi Root Mean Square Deviation (RMSD), Root Mean Square Fluctuation (RMSF), ikatan hidrogen, dan energi bebas ikatan berdasarkan metode MMGBSA. Hasil docking menunjukkan bahwa beberapa senyawa seperti D2, D4, dan D24 memiliki afinitas tinggi terhadap enzim target. Namun, dari hasil simulasi dinamika molekul, hanya senyawa D24 yang menunjukkan kestabilan interaksi yang baik, dengan nilai RMSD dan RMSF yang relatif rendah, serta jumlah ikatan hidrogen yang konsisten sepanjang simulasi. Energi bebas ikatan MMGBSA senyawa D24 juga mendekati ligan alami, mengindikasikan potensi sebagai inhibitor kompetitif. Hasil akhir penelitian ini senyawa D24 dari daun pacing menunjukkan potensi sebagai kandidat antidiabetes tipe II melalui mekanisme penghambatan enzim alfa glukosidase. Studi ini mendukung pengembangan obat berbasis bahan alam melalui pendekatan komputasi farmasi.

Kata Kunci: Costus speciosus, alfa glukosidase, antidiabetes, penambatan molekul, dinamika molekul.