Identifikasi Senyawa Metabolit Sekunder pada Ekstrak Etanol Danau Gaharu (Aquilaria malaccensis Lam) dan Penambatan Molekul Senyawa Terpenoid terhadap Enzim Lytm

Luka kaki diabetes merupakan salah satu komplikasi yang dialami
oleh penderita diabetes militus. Kondisi ini merupakan luka terbuka
pada bagian kulit karena adanya komplikasi sehingga dapat
berkembang menjadi infeksi. Salah satu jenis bakteri yang banyak
menginfeksi pada luka kaki diabetes yaitu bakteri Staphylococcus
aureus. Salah satu enzim yang terdapat dalam dinding sel bakteri
yaitu Lytm. Terpenoid bekerja dengan cara merusak dinding sel
bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui peran senyawa
terpenoid dari daun gaharu (Aquilaria malaccensis Lam) terhadap
enzim Lytm bakteri Staphylococcus aureus secara in silico.
Pendekatan yang digunakan secara in silico melalui metode docking
menggunakan Autodock 4.2. Tahapan docking meliputi validasi
docking uji, parameternya yaitu nilai RMSD <2Å dan docking
terhadap 5 senyawa uji golongan terpenoid dengan parameternya
yaitu nilai energi bebas ikatan (ΔG) dan konstanta inhibisi (Ki).
Hasil docking terbaik adalah senyawa 5 dengan nilai ΔG -6.36
kkal/mol dan 21,76 µM. Disimpulkan bahwa senyawa terpenoid dari
daun gaharu berperan sebagai aktivator Lytm yang baik.
Kata kunci : Daun gaharu, Docking, Infeksi, Lytm, Terpenoid