Virtual Screening Senyawa Obat Antikanker Kolon dari Database Tanaman Herbal terhadap Cyclin Dependent Kinase 2 Berbasis Farmakofor dan Molecular Docking

Kanker kolon merupakan kanker yang tumbuh di sistem pencernaan yang disebabkan karena pertumbuhan sel yang berlebihan. Tujuan penelitian ini adalah mencari kandidat senyawa obat baru berdasarkan virtual screening berbasis pharmacophor modeling dilakukan dengan LigandScout 4.0, dan molecular docking dilakukan dengan PyRx Screening Tool 0.8 (Vina Wizard dan AutodockWizard) dengan menggunakan database ZINC Natural Product. Hasil tahapan pharmacophore modeling diperoleh 355 senyawa dimana fitur farmakofornya telah divalidasi dengan nilai AUC dan EF berturut-turut adalah 0,52 dan 5,9. Tahap molecular docking menggunakan PyRx Screening Tool 0.8 diperoleh 32 senyawa dengan validitas AUC dan EF adalah 0,610 dan 44,17 untuk VinaWizard dan 0,598 dan 47,16 untuk Autodock Wizard. Dapat disimpulkan bahwa 32 senyawa yang diperoleh memiliki interaksi yang baik terhadap Cyclin dependent kinase 2 sehingga berpotensi aktif sebagai obat antikanker kolon.

Kata Kunci: Cyclin Dependent Kinase 2, virtual screening,
pharmacophore modeling, molecular docking, ZINC natural product