STUDI DOCKING, DINAMIKA MOLEKUL DAN PREDIKSI TOKSISITAS SENYAWA HASIL PENAPISAN VIRTUAL TERHADAP ZINC NATURAL PRODUCTS DATABASE SEBAGAI ANTAGONIS RESEPTOR A2APADA PENYAKIT PARKINSON

Abstract

Penyakit Parkinson terjadi karena perubahan ekspresi reseptor adenosin A2Adi ganglia basal, yang menunjukkan peran patologis pada reseptor ini. Antagonis reseptor adenosin A2Aberpotensi efektif pada pengobatan penyakit Parkinson. Tujuan penelitian ini ialah untuk memperoleh kandidat senyawa yang potensial sebagai antagonis reseptor A2Amelalui studi docking, dinamika molekul dan prediksi toksisitas. Senyawa uji merupakan hasil studi penapisan virtual terhadap basis data ZINC Natural Products. Dari 25 senyawa uji, diperoleh 11 senyawa yang memiliki afinitas lebih baik dari ligan alami. Hasil dockingterbaik yaitu senyawa ZINC12560456 menunjukkan nilai ΔG ˗10,50 kkal/mol dan nilai Ki 20,18 nM. Dilakukan simulasi dinamika molekul terhadap 11 senyawa uji dengan afinitas terbaik dengan reseptor target selama 50 ns. Hasil simulasi dinamika molekul menunjukkan senyawa ZINC12560456 memiliki kestabilan interaksi terhadap reseptor adenosin A2A, dibuktikan oleh grafik RMSD yang konstan dan stabil dengan nilai energi bebas ikatan terkecil melalui analisis MM/PBSA dan MM/GBSA yaitu ˗58,593kkal/mol. Parameter toksisitas yang diuji meliputi tes Ames, tes karsinogenik dan prediksi kardiotoksisitas. Senyawa ZINC12560456 diprediksikan bersifat non-mutagen, tidak bersifat karsinogenik dan memiliki risiko medium pada kardiotoksisitas. Disimpulkan bahwa senyawa ZINC12560456 dapat dijadikan sebagai kandidat senyawa yang berpotensi pada terapi Parkinson.