VIRTUAL SCREENING SENYAWA INHIBITOR β -SITE APP CLEAVING ENZYME 1 (BACE-1) SEBAGAI ANTIALZHEIMER BERBASIS PHARMACOPHORE MODELING DAN MOLECULAR DOCKING
Abstract
Alzheimer adalah penyakit neurodegeneratif progresif kronis, Terakumulasinya peptida βamiloiddi otak merupakan ciri patologis Alzheimer. Satu orang berusia di atas 65 tahun dari sepuluh orang di dunia dengan penyakit Alzheimer, Indonesia peringkat keempat lansiaterbanyak di dunia. Oleh sebab itu diperkirakan jumlah penderita Alzheimer setiap tahun akanmeningkat, Pada pencarian senyawa obat baru yang dilakukan secara in silico, β -SITE APPCLEAVING ENZYME 1 (BACE-1) adalah enzim yang penting untuk pengobatan alzheimer.Penelitian ini bertujuan untuk mencari kandidat senyawa obat baru berdasarkan metode virtualscreening berbasis pharmacophore modeling dan molecular docking menggunakan database ZINC Natural Product. Validasi berbasis farmakofor menunjukkan ada 4 jenis fitur farmakofor yaitu Hyrophobic, Positive Ionizable, Hydrogen Bond Acceptor, dan Hydrogen Bond Donor dengan nilai AUC 0,59 dan EF 30,60 menghasilkan 295 dari 151.837 senyawa. Untuk validasi berbasis molecular docking dengan vina wizard didapatkan nilai 0,84 dan EF: 51,11 menghasilkan 55 senyawa dari nilai binding affinity ligan alami yaitu -8,40 kkal/mol. Sedangkan validasi autodock wizard didapatkan nilai 0.55 dengan EF: 51.00 menghasilkan 22 senyawa dari nilai binding energy ligan alami yaitu -8,59 kkal/mol. Didapatkan yang diduga berpotensi sebagai antialzheimer, 3 hits terbaik yaitu ZINC32123980, ZINC85597385, dan ZINC85628869, memiliki ikatan salt bridge pada hits ZINC32123980 dan ZINC85628869 yang berikatan dengan residu asam amino ASP80.