UJI AKTIVITAS ANTIINFLAMASI KAROTENOID DARI NAVICULLA SP DENGAN METODE PENAMBATAN MOLEKUL
Abstract
Naviculla sp. merupakan mikroalga kelas diatom yang memiliki kandungan senyawa karotenoid.
Karotenoid adalah pigmen alami yang banyak disintesis di alam dan berpotensi sebagai
antiinflamasi. Pada umumnya inflamasi dapat diobati menggunakan obat golongan steroid (AIS)
dan nonsteroid (AINS). Namun, Penggunaan obat antiinflamasi nonsteroid dalam jangka panjang
dapat berakibat buruk pada kondisi fisiologis. Pada penelitian ini dilakukan uji aktivitas
antiinflamasi dari senyawa karotenoid yang terkandung dalam Naviculla sp secara in silico.
Metode penelitian yang dilakukan meliputi persiapan ligan uji karotenoid serta protein target
dengan ligan alami ibuprofen (COX-1) dan celecoxib (COX-2). Optimasi geometri, validasi dan
simulasi docking dilakukan pada senyawa uji. Hasil validasi docking dilakukan dengan melihat
parameter nilai RMSD, energi bebas Gibs (ΔG), dan nilai konstanta inhibisi (Ki). Dilakukan
penambatan molekul 7 ligan uji karotenoid dengan target 1EQG (COX-1) dan 3LN1 (COX-2).
Data aktivitas menunjukan bahwa ligan uji tidak memiliki interaksi pada COX-1. Namun, pada
COX-2 ligan uji memiliki aktivitas akan tetapi interaksi yang terjadi sangat lemah. Nilai ΔG ligan
alami pada COX-2 adalah -8,96 kkal/mol sedangkan senyawa uji dengan nilai ΔG paling rendah
dimiliki oleh senyawa betakaroten dengan nilai sebesar -1,51 kkal/mol. Seluruh senyawa uji
karotenoid pada mikroalga Naviculla sp. hanya memiliki aktivitas antiinflamasi pada COX-2, dan
aktivitas antiinflamasi pada COX-2 menunjukan interaksi yang lebih lemah dibandingkan dengan
ligan alami.