STUDI DOCKING, DINAMIKA MOLEKUL,DAN PREDIKSI TOKSISITAS SENYAWA GOLONGAN ALKALOID SEBAGAI INHIBITOR DIPEPTIDYL PEPTIDASE 4 (PADA PENYAKIT DIABETES TIPE II)

Abstract

Diabetes melitus (DM) merupakan kelainan metabolisme yang ditandai dengan resistensi terhadap insulin. Tujuan penelitian ini ialah untuk memperoleh kandidat senyawa yang potensial sebagai inhibitor DPP4 melalui studi docking, dinamika molekul dan prediksi toksisitas. Senyawa uji yang digunakan berasal dari basis data CHEMBL Products. Dari 16 senyawa uji, diperoleh 3 senyawa seperti CHEMBL 3127986 ,CHEMBL2159749 dan CHEMBL460937 yang memiliki afinitas lebih baik dari ligan alami. Hasil docking terbaik yaitu senyawa CHEMBL3127986 menunjukkan nilai ΔG ˗9,04 kkal/mol dan nilai Ki 4,25 nM. hasil simulasi dinamika molekul terhadap 3 senyawa selama 50ns, kemudian hasil simulasi dinamika molekul menunjukkan senyawa CHEMBL3127986 tidak menunjukan kestabilan interaksi terhadap protein target Dipeptidyl Peptidase 4 dibuktikan oleh grafik RMSD. Setelah itu dilakukan uji prediksi toksisitas dengan parameter meliputi tes Ames, tes karsinogenik dan prediksi kardiotoksisitas. Senyawa terbaik hasil docking CHEMBL3127986 diprediksikan bersifat mutagen. Sehingga dapat disimpulkan bahwa senyawa CHEMBL3127986 dan 2 senyawa lainnya masih perlu dilakukan prediksi toksisitas secara komputasi terhadap parameter uji lainnya.