PENAMBATAN MOLEKUL DAN DINAMIKA MOLEKUL SENYAWA TURUNAN XANTHONE SEBAGAI SENYAWAANTI KANKER DARAH

Abstract

Kanker darah merupakan kanker yang menempati urutan ke sembilan terbanyak di Indonesia dimana 4,1% dari penduduk Indonesia mengidap penyakit ini. Xanthone diketahui memiliki aktivitas anti kanker, sehingga dapat diprediksi senyawa ini memiliki aktivitas dengan mekanisme menginhibisi pada protein target Bcl-2. Penelitian ini bertujuan mendapatkan gambaran interaksi senyawa uji dengan protein target Bcl-2 (PDB ID 6GL8) dan stabilitas interaksinya. Tahapan awal dilakukan penambatan molekul terhadap sepuluh senyawa uji turunan xanthone. Parameter penambatan molekul yang digunakan adalah nilai energi bebas ikatan (ΔG) dan konstanta inhibisi (ki) dan kemudian analisis dilanjutkan dengan melakukan dinamika molekul terhadap senyawa uji dengan rentang waktu 50 nanodetik. Hasil penambatan molekul terbaik adalah senyawa uji turunan xanthone 8 nilai energi bebas ikatan (ΔG) dan konstanta inhibisi (ki) berturut-turut adalah -6,55 kkal/mol dan 15,90 μM. Analisis dinamika molekul diperoleh nilai energi bebas ikatan (ΔG) terbaik dimiliki senyawa turunan xanthone 3 dengan nilai -22,46 kkal/mol. Disimpulkan bahwa senyawa turunan xanthone dapat membuat interaksi cukup baik anatara protein target Bcl-2 dan senyawa uji turunan xanthone.