PENAMBATAN MOLEKUL DAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL SENYAWA ALKALOID IMIDAZOL DAN INDOL SEBAGAI ANTAGONIS ADENOSIN A2A UNTUK PENYAKIT PARKINSON
Abstract
Parkinson merupakan penyakit degeneratif jangka panjang yang mempengaruhi sistem motorik yang terjadi dalam sistem saraf pusat di otak. Terapi antiparkinson saat ini memiliki efek samping yang signifikan seperti halusinasi, dan hipotensi. Salah satu reseptor yang berperan penting dalam mengatur sistem motorik adalah reseptor Adenosin A2A. Penghambatan reseptor Adenosin A2A dapat meningkatkan kerja sistem motorik dalam sistem saraf pusat. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh senyawa pemandu dari alkaloid golongan imidazol dan indol yang berpotensi sebagai antiparkinson melalui mekaninsme penghambatan pada reseptor Adenosin A2A. Pendekatan yang digunakan secara in silico melalui metode penambatan molekul menggunakan AutoDock 4.2, dan dilanjutkan dengan metode simulasi dinamika molekul menggunakan AMBER 18. Simulasi penambatan molekul 25 senyawa uji dilakukan setelah diperoleh lokasi penambatan yang valid. Nilai ΔG untuk tiga senyawa dengan energi terbaik (22, 17, dan 21) berturut-turut adalah ˗10,17; ˗10,02; dan ˗9,66 kkal/mol dilanjutkan ke tahap MD. Hasil simulasi dinamika molekul untuk senyawa 22, 17, dan 21menunjukkan kestabilan dicapai pada waktu berturut –turut setelah 17, 23, dan 35 ns dengan nilai energi bebas ikatan MMGBSA secara berturut-turut adalah ˗48,73; ˗47,15; dan ˗42,46 kkal/mol. Disimpulkan bahwa senyawa alkaloid indol dengan kode ligan 22dan 17 berpotensi sebagai senyawa pemandu yang memiliki afinitas dan stabilitas interaksi terhadap reseptor Adenosin A2A.