STUDI DOCKING, DINAMIKA MOLEKUL,DAN PREDIKSI TOKSISITAS SENYAWA GOLONGAN ALKALOID SEBAGAI INHIBITOR DIPEPTIDYL PEPTIDASE 4 (PADA PENYAKIT DIABETES TIPE II)
Abstract
Diabetes melitus (DM) merupakan kelainan metabolisme yang ditandai dengan
resistensi terhadap insulin. Tujuan penelitian ini ialah untuk memperoleh kandidat
senyawa yang potensial sebagai inhibitor DPP4 melalui studi docking, dinamika
molekul dan prediksi toksisitas. Senyawa uji yang digunakan berasal dari basis data
CHEMBL Products. Dari 16 senyawa uji, diperoleh 3 senyawa seperti CHEMBL
3127986 ,CHEMBL2159749 dan CHEMBL460937 yang memiliki afinitas lebih baik
dari ligan alami. Hasil docking terbaik yaitu senyawa CHEMBL3127986
menunjukkan nilai ΔG ˗9,04 kkal/mol dan nilai Ki 4,25 nM. hasil simulasi dinamika
molekul terhadap 3 senyawa selama 50ns, kemudian hasil simulasi dinamika molekul
menunjukkan senyawa CHEMBL3127986 tidak menunjukan kestabilan interaksi
terhadap protein target Dipeptidyl Peptidase 4 dibuktikan oleh grafik RMSD. Setelah
itu dilakukan uji prediksi toksisitas dengan parameter meliputi tes Ames, tes
karsinogenik dan prediksi kardiotoksisitas. Senyawa terbaik hasil docking
CHEMBL3127986 diprediksikan bersifat mutagen. Sehingga dapat disimpulkan
bahwa senyawa CHEMBL3127986 dan 2 senyawa lainnya masih perlu dilakukan
prediksi toksisitas secara komputasi terhadap parameter uji lainnya.